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分析目的

基因家族分析是生物信息學(xué)和遺傳學(xué)中的一個(gè)重要研究方法，它涉及到基因功能，基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制，進(jìn)化研究，疾病關(guān)聯(lián)研究，藥物開(kāi)發(fā)等重要領(lǐng)域，目前進(jìn)行基因家族分析，然后做qPCR、亞細(xì)胞定位實(shí)驗(yàn)基本就可以發(fā)個(gè)不錯(cuò)的文章，是性價(jià)比非常高的研究方法。

數(shù)據(jù)來(lái)源
  自測(cè)數(shù)據(jù)或公共數(shù)據(jù)庫(kù)里的基因組、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。

分析方法
  基于序列相似性或結(jié)構(gòu)域，進(jìn)行基因家族的鑒定；使用MEME等工具對(duì)基因家族成員進(jìn)行motif分析，以識(shí)別序列中的保守區(qū)域，此外，進(jìn)行基因結(jié)構(gòu)分析，包括內(nèi)含子、外顯子和CDS的位置，構(gòu)建并分析基因家族成員的進(jìn)化樹(shù)。

分析內(nèi)容
（1）基因結(jié)構(gòu)分析(外顯子內(nèi)含子，motif分析)
（2）家族基因重復(fù)事件分析
（3）家族基因進(jìn)化分析
（4）家族成員在不同組織中特異性表達(dá)分析
（5）基因亞細(xì)胞定位，蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析